1: 2015/02/17(火) 00:24:31.13 ID:???.net
掲載日:2015年2月16日
http://www.kobe-np.co.jp/news/shakai/201502/0007744757.shtml

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 神戸市は2015年度、ポートアイランド2期の神戸医療産業都市にあるスーパーコンピューター(スパコン)「京」などを使い、薬の候補となる化合物を従来より素早く低コストで見つけるため、製薬企業向けのソフトを開発する。
京は12年に本格稼働したが、その高い計算能力を生かせるソフトが不足し、創薬(医薬品の研究開発)が遅れていた。
京や20年の完成を目指す後継機「エクサ級スパコン」を使い、難病などの創薬加速が期待される。

 創薬は従来、化合物と、病気の原因となるタンパク質との結合の強さを実験で調べていたが、開発までに10年以上、1千億円以上かかっていた。実験の代わりに、スパコンによる計算で結合を予測できれば、期間を2~3年、コストは約200億円削減できる可能性があるという。

 ソフトは市の外郭団体、先端医療振興財団(同市中央区)の奥野恭史グループリーダー(京都大大学院特定教授)らが15年度中に開発し、16年度以降は企業から利用料を受け取って開発・運営費に充てる。市は15年度当初予算案に関連費用4800万円を計上した。

続きはソースで
(金井恒幸)

<画像>
創薬分野での利用が進むスーパーコンピューター「京」=神戸市中央区港島南町7
http://www.kobe-np.co.jp/news/shakai/201502/img/b_07745891.jpg

<参照>
KAKEN - 奥野 恭史(20283666)
https://kaken.nii.ac.jp/d/r/20283666.ja.html

引用元: 【医療】スパコン「京」で創薬加速 神戸市、企業向けにソフト開発

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3: 2015/02/17(火) 00:37:50.54 ID:4wsvTOWz.net
南海地震時の津波対策万全か?

人口島だから10メターの津波で回復不可能じゃね?

4: 2015/02/17(火) 00:55:50.36 ID:pJ4zBYaz.net
「実験の代わりに、スパコンによる計算で結合を予測できれば」
これが肝なんだよなー
結合力の予測は素人が考えるよりもずーと難しい。
過去にも欧米の製薬企業がやったがほとんどものにならなかった。
なぜなら、人類は結合力の本質をきちんと理解できていないから。
理解できてないもの(数式で表せない)はコンピューターで計算できない。
その難しさは天気予報みたいなものだ。

6: 2015/02/17(火) 06:05:31.74 ID:Ikl5f8WR.net
インシリコ創薬なんてメジャーな製薬会社はとっくにやってるだろ。
「関連費用4800万円」この金額のショボさが全てを物語っているな。

10: 2015/02/17(火) 22:03:52.36 ID:Nj0jlnrU.net
分散型PCじゃダメなのかね?素人発想でゴメン。

11: 2015/02/17(火) 23:41:41.39 ID:G6gDAaz9.net
>>10
問題ない

12: 2015/02/18(水) 03:56:10.42 ID:Fjz8+4OH.net
>>10
医薬品はバンド幅への依存は強くないようなので構成考えればいけると思う。
その辺のPCを1000Baseでつないだようなのだとさすがにダメだと思うが。

14: 2015/02/20(金) 21:56:41.49 ID:uXAijBeA.net
なぜ製薬会社が自分で計算機を買わないのだ?

25: 2015/02/23(月) 13:47:34.41 ID:DSV/dqBh.net
演算性能に対して、メモリバンドや通信速度が遅い
安物スカラクラスタは、チューニングするのにすごく苦労する割には、
カタログスペックに程遠い性能しか出ない。

そんなもんだ。

26: 2015/02/23(月) 14:04:00.36 ID:lzUuBgUd.net
東工大、中国以下のスパコン

27: 2015/02/23(月) 14:47:06.69 ID:w8gPPqhl.net
中国のスパコンなんてまともに稼働してないし
東工大のTsubameはGPUで使い難いし
どこも一長一短

28: 2015/02/23(月) 17:39:09.79 ID:DSV/dqBh.net
GPUでカタログスペックをドーピングしても、
実際の性能は悲惨なもんだ。

TSUBAMEも中国のスパコンも、GPUでドーピングしてたね。

29: 2015/02/24(火) 05:26:56.28 ID:PyFBHozO.net
スパコンってさ最先端の研究のためのシミュレータとして動けば御の字でしょう
手間かかるにしても使えるだけマシだよ
スパコンのランキングに載ってるスパコンなんてどれも大して実用的でもない

30: 2015/02/24(火) 09:06:59.57 ID:EzdAo3ma.net
京の開発費1100億なんか金かけすぎって10年近く前から批判されるけどさ。
その割りには銀行なり国プロなり100億円融資受けて京に匹敵するスパコンを作ろうって奴が未だに1人も出てこない。
言うだけ番長なら幼稚園児にも出来るわ。

作ったからには有効活用すべきなんだよ。

33: 2015/03/15(日) 08:59:34.14 ID:omTKx4q1.net
これからはFX-100ですよ。もうFX-10とか京は古いね。

35: 2015/03/16(月) 17:31:28.30 ID:5oUpLB3E.net
創薬をする製薬会社が世界最大級のスパコンセンターを公然とあるいは秘密裏に
多数保有するようになれば、日立やNECや富士通も儲かって助かるのに。
もっとも、電気の供給のために火力発電所建てないといけなくなるから
難しいのかな。

9: 2015/02/17(火) 09:42:18.87 ID:oPSPTrIs.net
薬品業界に金出してもらうにはまず成功例を出すことが重要だろう
膨大なデータベースから検索するタイプのソフトなら将棋ソフトのアルゴリズムも有効な気がする