1: 依頼@ベガスφ ★ 2013/10/04(金) 21:36:31.03 ID:???

"東大、がん治療の標的遺伝子スピード特定 治療薬開発効率化 "

東京大学医科学研究所の宮野悟教授らはスーパーコンピューターを使い、がん治療の標的となりそうな遺伝子を効率よく探し出す手法を開発した。
この手法を生かして3カ月で、がん転移にかかわるとみられる遺伝子を新たに10種類見つけた。
従来は数年かけて1種類の遺伝子を特定する例が多かった。
抗がん剤の開発スピード向上につながると期待している。

成果は3日から横浜市で始まる日本癌(がん)学会で発表する。
転移や薬剤耐性などに関する遺伝子が分かれば創薬の糸口になる。

経済学やマーケティングなどで使う因果関係を調べる統計手法を遺伝子解析に応用した。
遺伝子は影響しあっており、ある遺伝子がつくったたんぱく質は、他の遺伝子がつくるたんぱく質の量を左右する。
たんぱく質量に関わる大量のデータから相互の関係をスパコンで予測し、がんの性質にかかわる遺伝子候補を短時間で見つける。

実験では700種類のがん細胞で働く1万種類以上の遺伝子をスパコンで調べた。
がん転移にかかわるとみられる遺伝子が24種類特定できた。このうち14個はすでに転移関連遺伝子だと知られており、新手法が有効だと確かめられた。
理化学研究所のスパコン「京」を活用できれば、計算時間は1時間ですむという。

従来は遺伝子を1つずつ実験で調べて働きを解明するのが一般的で、膨大な時間がかかっていた。

0343a352.jpg

2013/10/2 13:16
http://www.nikkei.com/article/DGXNASGG01014_S3A001C1CR0000/



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2: 名無しのひみつ 2013/10/04(金) 21:47:14.04 ID:ErPVwweV

3ヶ月が1時間か....
昼食食べたら答えが出るのか。


3: 名無しのひみつ 2013/10/04(金) 21:48:13.46 ID:sQGN5fM0

こんなことやってもそう簡単にガンは治らんよ。


4: 忍法帖【Lv=40,xxxPT】(1+0:8) 2013/10/04(金) 21:50:22.57 ID:G0HL/mj1

.
 遺伝子の解析法
 遺伝子の発現と制御

 まで分かっていて、最後は

 遺伝子の完全修復

 だけなんだがなぁ。


5: 名無しのひみつ 2013/10/04(金) 21:54:23.17 ID:aEiUEcEe

スパコンの使えなさは異常


6: 名無しのひみつ 2013/10/04(金) 22:08:13.72 ID:Q8T+oo/z

「3ヶ月じゃダメなんですか!!?(゚Д゚#)」


7: 名無しのひみつ 2013/10/04(金) 22:10:02.56 ID:nO36W8jy

ハードウェアとソフトウェアはセットだ
スパコンに相当するソフトウェアを開発するべきなんだ
日本のマスコミは馬鹿だからだれもいわない


8: 名無しのひみつ 2013/10/04(金) 23:10:48.85 ID:x2+51oHg

京最大の欠点は、これ以上かいりょうの余地がないこと


10: 名無しのひみつ 2013/10/05(土) 08:09:23.81 ID:GEuAVjj4

>>8
アホか、まだまだパワーアップできるわ


9: 名無しのひみつ 2013/10/04(金) 23:37:44.61 ID:/XgUM8HO

3か月も列に並んでいられないからな。


13: 名無しのひみつ 2013/10/05(土) 12:13:47.58 ID:YeBRNwFl

世間ではGPUが注目されてるんだが
スパコンでも使えないの?


18: 名無しのひみつ 2013/10/05(土) 17:11:53.68 ID:3kcNAuhZ

>>13
TSUBAME


19: 名無しのひみつ 2013/10/05(土) 19:26:17.95 ID:7DU+zmKO

>>18
GPUがあればスパコンは事足りる時代なんだよな。


15: 名無しのひみつ 2013/10/05(土) 12:46:40.85 ID:gayHkG1r

大学のスパコンってどの程度の実力なんだろ
中古のCore2系Celeronを大量並列でもしてるのかな?


18: 名無しのひみつ 2013/10/05(土) 17:11:53.68 ID:3kcNAuhZ

>>15
京の改良版のFX-10を導入しているところもある


21: 名無しのひみつ 2013/10/05(土) 21:38:02.00 ID:6ZNGCYL7

1時間なら、余命半年の末期がん患者個人の治療の研究に役立つ速さだ。


22: 名無しのひみつ 2013/10/05(土) 21:40:56.28 ID:tlki2sNh

期待できそうな治療法が学術レベルで発表されても、何年待っても
治験が進まないのを何とかして欲しい。


24: 名無しのひみつ 2013/10/05(土) 23:10:33.28 ID:0ZsX8USA

京をつかって1万種以上の遺伝子を統計解析か
しかし実験データを必要とするんだな
手法的に飛躍があるわけじゃなく単に力技って感じだねぇ


25: 名無しのひみつ 2013/10/06(日) 04:31:59.47 ID:9947Tnrj

原論文を読んでないがビッグデータとかそういう感じ?
力技と言えば力技だけどコンピューター無しの人手じゃ無理だし。


26: 名無しのひみつ 2013/10/06(日) 23:09:22.54 ID:q5LAjvwL

これからの新薬は、電力(演算)の塊になるのかもね。
米国なんかでは、儲かるなら1都市レベルの電力をスパコンにつぎ込みかねない。


14: 名無しのひみつ 2013/10/05(土) 12:42:48.83 ID:9wU75b8W

民主党とその投票者にはスパコンの成果は保険適用除外で


引用元: 【ゲノム】スパコンを用いがん治療の標的遺伝子スピード特定、抗がん剤の開発スピード向上につながる /東大