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ポートアイランド

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1: 2015/02/17(火) 00:24:31.13 ID:???.net
掲載日:2015年2月16日
http://www.kobe-np.co.jp/news/shakai/201502/0007744757.shtml

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 神戸市は2015年度、ポートアイランド2期の神戸医療産業都市にあるスーパーコンピューター(スパコン)「京」などを使い、薬の候補となる化合物を従来より素早く低コストで見つけるため、製薬企業向けのソフトを開発する。
京は12年に本格稼働したが、その高い計算能力を生かせるソフトが不足し、創薬(医薬品の研究開発)が遅れていた。
京や20年の完成を目指す後継機「エクサ級スパコン」を使い、難病などの創薬加速が期待される。

 創薬は従来、化合物と、病気の原因となるタンパク質との結合の強さを実験で調べていたが、開発までに10年以上、1千億円以上かかっていた。実験の代わりに、スパコンによる計算で結合を予測できれば、期間を2~3年、コストは約200億円削減できる可能性があるという。

 ソフトは市の外郭団体、先端医療振興財団(同市中央区)の奥野恭史グループリーダー(京都大大学院特定教授)らが15年度中に開発し、16年度以降は企業から利用料を受け取って開発・運営費に充てる。市は15年度当初予算案に関連費用4800万円を計上した。

続きはソースで
(金井恒幸)

<画像>
創薬分野での利用が進むスーパーコンピューター「京」=神戸市中央区港島南町7
http://www.kobe-np.co.jp/news/shakai/201502/img/b_07745891.jpg

<参照>
KAKEN - 奥野 恭史(20283666)
https://kaken.nii.ac.jp/d/r/20283666.ja.html

引用元: 【医療】スパコン「京」で創薬加速 神戸市、企業向けにソフト開発

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1: ◆CHURa/Os2M @ちゅら猫ρ ★ 2014/02/26(水) 17:57:46.52 ID:???0

★神戸のスパコン「京」後継機 エクサ級開発へ

神戸・ポートアイランドのスーパーコンピューター「京」の後継機「エクサ級スパコン」の開発が、2014年度に始まる。建設場所は京の所在地が有力。開発主体の理化学研究所(理研)計算科学研究機構(神戸市)は20年の稼働を目標に、プロジェクト準備室を設置し、始動に備える。
京の100倍の処理能力を持つエクサ級の可能性と課題を探った。

「計算科学に質的な変化が起こる」。同機構の平尾公彦機構長は、1秒間に100京(エクサ=1兆の100万倍)回の計算ができるエクサ級の意義を強調する。

例えば創薬。京でも、抗がん剤の候補物質を10種類以上発見するなどの成果を挙げているが、エクサ級では分析できる化合物の数が飛躍的に増える。体内に近い条件でのシミュレーションもでき、副作用の少ない新薬開発の可能性も開ける。

ほかにも宇宙の起源の探究や風洞実験なしの自動車開発、複合災害の被害予測など、基礎科学から産業利用まで幅広い活用が想定される。「実験の後追い」から、科学現象を前もって推測する「予測の科学」へ。そうした質的な変化が期待されるという。
                           
■エクサ級の開発は、欧州や中国も20年ごろを目標に掲げ、国際競争は激しさを増す。
開発を始めるには「ギリギリの時期」というのが一致した見方だ。

京は一時、世界1位を誇ったが、現在は4位に後退した。1位奪還を期待する声もあるが、「それが目標ではない」とプロジェクト準備室の石川裕室長は否定する。

リンパックと呼ばれる現在の性能指標は特殊な連立方程式を解く速さで測るが、実際の研究に必要な能力とは異なるという。「順位が上でも速度が出ない計算機もある」と、世界のスパコン状況に詳しい神戸大の小柳義夫特命教授は指摘する。

石川室長は「重視するのは、あくまで科学的成果を出せるスパコン」と述べる。(以下略)

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http://www.kobe-np.co.jp/news/shakai/201402/0006736154.shtml



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