共同発表：外来ＤＮＡの混入を防ぎ、信頼性の高いＤＮＡ解析を可能にする卓上型クリーンルームを開発
http://www.jst.go.jp/pr/announce/20160713-2/index.html
http://www.jst.go.jp/pr/announce/20160713-2/icons/zu3.jpg


ポイント
すべてのＤＮＡ解析方法において、外来ＤＮＡの混入は重大で防ぎづらい問題だった。
空気中を浮遊する微粒子が主な汚染源であり、実験器具の静電気も重大な要因であることを明らかにした。
ＤＮＡの混入をほぼ完全に防止できる、ＤＮＡ増幅用の卓上型クリーンルームを開発した。


ＪＳＴ 戦略的創造研究推進事業において、広島大学の高橋 宏和　研究員および岡村 好子　准教授らは、外来ＤＮＡの混入を防止し、信頼性の高い極微量ＤＮＡ解析を可能にする卓上型クリーンルームを開発しました。

従来、ＤＮＡ増幅を行う場合には、外来ＤＮＡの混入（コンタミネーション）を防止するために、主に無菌操作用のクリーンベンチが使用されていました。しかしながら、外来ＤＮＡの混入を完全に防ぐことは難しく、１細胞レベルの極微量のＤＮＡ、特に全ゲノムを増幅注１）する場合には大きな問題となっていました。

本研究グループは、従来の実験環境において、注意深く全ゲノム増幅の操作を行った場合でも生じてしまうコンタミネーションの主原因が、実験環境中の浮遊微粒子（主成分は直径０．１µｍ）であること、また実験器具に発生する静電気が外来ＤＮＡを含む浮遊微粒子を集めてしまうことを、明らかにしました。

さらに、主に半導体などの研究用に用いられる、国際標準規格ＩＳＯ－１の清浄度（全微粒子数が１０個／ｍ３以下、図１）の空間を形成する既存のクリーンシステムをベースに、外来ＤＮＡの混入をほぼ完全に防止してＤＮＡ増幅を行うことができる新しい卓上型クリーンルームを開発しました。

開発した卓上型クリーンルームは、培養できない微生物注２）からの有用遺伝子探索など、さまざまな基礎研究分野での遺伝子解析のみならず、ガン研究などにも貢献することが期待されます。

本研究は、農研機構（国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構）の小堀 俊郎　研究員らとの共同で、興研株式会社と関東化学株式会社の協力を得て行いました。本研究成果は、２０１６年７月１２日（米国東部時間）に米国科学誌「ＢｉｏＴｅｃｈｎｉｑｕｅｓ」のオンライン速報版で公開されます。

続きはソースで

 

理研、小保方氏の告訴見送り…謎残し究明終える
http://headlines.yahoo.co.jp/hl?a=20150316-00050081-yom-sci



ＳＴＡＰ（スタップ）細胞の論文不正問題で、理化学研究所は、捏造（ねつぞう）など不正４件を認定した小保方晴子・元研究員（３１）の刑事告訴はしない方針を決めた。

　近く理研の不正防止策などに対する評価をまとめる外部有識者らの「運営・改革モニタリング委員会」も、告訴見送りを容認する見通し。ＳＴＡＰ問題は、昨年１月の論文発表から約１年２か月を経て、不正の経緯に謎を残したまま、真相究明を終えることになる。

　理研は先月、小保方氏を「懲戒解雇相当」とする処分を発表。「ＳＴＡＰ細胞は、別の万能細胞であるＥＳ細胞（胚性幹細胞）が混入したもの」とした昨年末の調査結果に基づき、小保方氏を含む誰かが理研のＥＳ細胞を盗んだ可能性などを検討した。

　しかし、関係者によると、保管中のＥＳ細胞は誰でも持ち出せる状態で、混入の経緯は突き止められていない。理研が弁護士と相談した結果、故意ではなく器具の誤操作で混入した可能性も排除できず、新たな証拠を得る見通しはないと判断。告訴の要件に該当するような疑義はないと結論づけたという。

　また、小保方氏の不正が理研の業務を妨害したとまでは認められないと判断した。

理化学研究所は１５日、ＳＴＡＰ幹細胞として保管されていた細胞などのゲノム（全遺伝情報）配列を国立遺伝学研究所のデータベースで公開した。
理研の調査委員会は昨年末、ＳＴＡＰ論文の調査結果を発表、ＳＴＡＰ細胞は既存の万能細胞である胚性幹細胞（ＥＳ細胞）が混入したものとほぼ断定したが、その根拠となったデータ。
　理研広報室は「科学者や関連学会に対する説明のため公開した」としている。
　公開されたのは、小保方晴子氏や共著者の若山照彦氏の研究室で保管されていたＳＴＡＰ幹細胞やＥＳ細胞など１１種類と、その細胞が由来するマウスなどのゲノム。

http://www.47news.jp/smp/CN/201501/CN2015011501001013.html

参考

STAP関連細胞株ゲノム配列データの公開について

「STAP関連細胞株ゲノム配列データ」を国立遺伝学研究所 日本DNAデータバンク (DDBJ) センターの
DDBJ Sequence Read Archive (DRA)に公開したのでお知らせ致します。

なお、公開したゲノム配列データは以下の15種類です。

[STAP関連細胞株]
* FLS3
* GLS1
* AC129-1
* 129/GFP ES
* 129B6F1-6 ES
* CTS1
* 129B6F1G1 (ntES1)
* 129B6GFP1 FES♂ (FES1)
* GOF ES
* 129B6F1G2 (ntES2)
* 129B6GFP2 FES♂ (FES2)
[関連マウス由来]
* GOF mouse
* 129 CAG-GFP mouse
* B6 CAG-GFP mouse
[ChIP-Seq input 用サンプル由来]
* STAP cell lysate

http://www.riken.jp/pr/topics/2015/20150115_1/

参考

遺伝研のデータベース
上記のWGSデータがあります

http://trace.ddbj.nig.ac.jp/DRASearch/submission?acc=DRA002862

掲載日：2014/12/26

　理化学研究所(理研)は12月26日、都内で会見を開き、外部の有識者で構成された調査委員会によるSTAP細胞論文の疑義に関する調査結果について発表した。

　調査委員会は、STAP細胞が多能性を持つという証拠となるべきキメラ、テラトーマなどは、すべてES細胞の混入に由来するか、あるいはそれで説明できると断定。ただし、ES細胞の混入が故意によるものか、過失によるものかは同調査では判定ができなかった。

　不正が指摘されていた論文中の２つの図については小保方晴子氏によるデータの捏造を認定した。聞き取り調査で小保方氏は「もともとの図では論文に使えないと言われた」と語り、意図的にデータを操作したことを認める発言をしたという。

　また、論文の共著者で同氏を指導する立場であった山梨大学の若山照彦 教授と理研の丹羽仁史氏の不正は認められなかった。

続きはソースで

<画像>
桂勲 調査委員長
http://news.mynavi.jp/news/2014/12/26/200/images/001l.jpg

調査結果のまとめ
http://news.mynavi.jp/news/2014/12/26/200/images/002l.jpg

<参照>
STAP細胞論文に関する調査結果について | 理化学研究所
http://www.riken.jp/pr/topics/2014/20141226_1/

調査報告書（全文）
http://www3.riken.jp/stap/j/c13document5.pdf
調査報告書（スライド）
http://www3.riken.jp/stap/j/h9document6.pdf
野依良治理事長コメント
http://www3.riken.jp/stap/j/o15document3.pdf

「研究不正再発防止をはじめとする高い規範の再生のためのアクションプラン」への取組状況について | 理化学研究所
http://www.riken.jp/pr/topics/2014/20141226_2/

「研究不正再発防止をはじめとする高い規範の再生のためのアクションプラン」への取組状況
http://www3.riken.jp/stap/j/u12document18.pdf

<記事掲載元>
http://news.mynavi.jp/news/2014/12/26/200/